Παρακαλώ χρησιμοποιήστε αυτό το αναγνωριστικό για να παραπέμψετε ή να δημιουργήσετε σύνδεσμο προς αυτό το τεκμήριο: http://hdl.handle.net/11400/10372
Τίτλος: Microarray image enhancement techniques using the discrete wavelet transform
Συγγραφείς: Αθανασιάδης, Εμμανουήλ Ι.
Γκλώτσος, Δημήτριος
Δασκαλάκης, Αντώνης
Μπουγιούκος, Παναγιώτης
Κωστόπουλος, Σπυρίδων
Συντελεστές: Θεοχαράκης, Παντελής
Σπυρίδωνος, Παναγιώτα Π.
Καλατζής, Ιωάννης
Νικηφορίδης, Γεώργιος Σ.
Κάβουρας, Διονύσης Α.
Τύπος αντικειμένου: Δημοσίευση σε συνέδριο
Τύπος δημοσίευσης σε συνέδριο: Πλήρης δημοσίευση (full paper)
Λέξεις-κλειδιά: Microarray;Wavelets (Mathematics);Μικροσυστοιχίες;Κυμάτιο
Θέματα: Technology
Computer science
Τεχνολογία
Πληροφορική
Ημερομηνία Δημοσίευσης: 14-Μαΐ-2015
2006
Ημερομηνία Διαθεσιμότητας: 14-Μαΐ-2015
Περίληψη: The objective of this work was to perform a comparative evaluation of five different wavelet-based filtering techniques in the task of microarray image denoising and enhancement. Clinical material comprised microarray images collected from the Oak Ridge National Laboratory. Image processing was performed in two stages: In the first stage an Exponential Histogram Equalization filter was applied in order to increase the contrast between spots and surrounding background. In the second stage, five wavelet-based image filters (Simple Piece-Wise Linear Mapping Filter (SPWLMF), Hard Threshold filter (HTF), Wavelet Enhancement with Noise Suppression filter (WEWNSF), Garrote Wavelet Threshold filter (GWTF) and Sigmoidal Non-linear Enhancement filter (SNLEF)) were implemented for denoising and enhancing gene microarray spots. The enhancing effectiveness of the five filters was assessed by calculating the Mean-Square-Error (MSE) and the Signal-to-MSE ratio. Results showed that the image quality of the processed images was superior to that of the original images. Significant noise suppression was accomplished by the SPWLMP filter, which scored the minimum MSE and the maximum Signal-to-MSE ratio. Processing time was less than 3 seconds for 512x512 sample images. Wavelet-based processing of microarray images was found to enhance microarray images effectively, by improving the visualization of spots and by suppressing image noise.
Γλώσσα: Αγγλικά
Βιβλιογραφική αναφορά: Athanasiadis, E., Glotsos, D., Daskalakis, A., Bougioukos, P., Kostopoulos, S., et al. (2006). Microarray image enhancement techniques using the discrete wavelet transform. In the 2nd International Conference "From Scientific Computing to Computational Engineering" (2nd IC-SCCE 2006). Athens, 5th – 8th July, 2006. Available from: http://www.bme.teiath.gr/medisp/pdfs/ATHANASSIADIS_2006_SCCE_Microarray%20Image%20Enhancement.pdf
Συνέδριο: International Conference "From Scientific Computing to Computational Engineering"
Πρόσβαση: Δημόσια διαθέσιμο
Άδεια χρήσης: Αναφορά Δημιουργού-Μη Εμπορική Χρήση-Όχι Παράγωγα Έργα 3.0 Ηνωμένες Πολιτείες
URI: http://hdl.handle.net/11400/10372
Εμφανίζεται στις συλλογές:Δημοσιεύσεις

Αρχεία σε αυτό το τεκμήριο:
Αρχείο Περιγραφή ΜέγεθοςΜορφότυπος 
Microarray Image Enhancement Techniques Using the Discrete Wavelet Transform.pdf396.7 kBAdobe PDFΔείτε/ Ανοίξτε


Αυτό το τεκμήριο προστατεύεται από άδεια Άδεια Creative Commons Creative Commons