Παρακαλώ χρησιμοποιήστε αυτό το αναγνωριστικό για να παραπέμψετε ή να δημιουργήσετε σύνδεσμο προς αυτό το τεκμήριο: http://hdl.handle.net/11400/10403
Τίτλος: Segmentation of microarray images using gradient vector flow active contours boosted by gaussian mixture models
Συγγραφείς: Αθανασιάδης, Εμμανουήλ Ι.
Κάβουρας, Διονύσης Α.
Σπυρίδωνος, Παναγιώτα Π.
Γκλώτσος, Δημήτριος
Καλατζής, Ιωάννης
Συντελεστές: Νικηφορίδης, Γεώργιος Σ.
Τύπος αντικειμένου: Δημοσίευση σε συνέδριο
Τύπος δημοσίευσης σε συνέδριο: Poster
Λέξεις-κλειδιά: Microarrays;Active Contours;Μικροσυστοιχίες;Ενεργά περιγράμματα
Θέματα: Medicine
Biomedical engineering
Ιατρική
Βιοϊατρική τεχνολογία
Ημερομηνία Δημοσίευσης: 14-Μαΐ-2015
2007
Ημερομηνία Διαθεσιμότητας: 14-Μαΐ-2015
Περίληψη: In this paper, a new methodology for the segmentation of cDNA microarray images is proposed, based on the combination of Gaussian Mixture Models (GMM) with Gradient Vector Flow (GVF) active contours. A simulated microarray image of 1000 spots was produced using a standard procedure. 5 real microarray images were used to evaluate the performance of our algorithm. GMM was firstly applied in all individual cells (spot with each background). The output was used to initialize a GVF active contour. The major advance of our method is that it overcomes limitations of both GMM and active contours when used individually. Segmentation matching factors and mean intensity values were calculated for every cell using GMM, GVF, and the combination of GMM and GVF in the simulated data. Pairwise correlations and mean absolute errors were also calculated by using real microarrays. Numerical experiments using both simulated and real images showed that our method was more accurate in measuring intensity values and detecting actual boundaries of spots, compared with GMM and active contours used individually. Results concerning the segmentability and the mean intensity value of the proposed algorithm were more accurate, as compared with those methods when used individually.
Γλώσσα: Αγγλικά
Βιβλιογραφική αναφορά: Athanasiadis, E., Cavouras, D., Spyridonos, P., Glotsos, D., Kalatzis, I., et al. (2007). Segmentation of microarray images using gradient vector flow active contours boosted by gaussian mixture models. In the 2nd International Conference on Experiments/ Process/ System Modelling/ Simulation/ Optimization (2nd IC-EpsMsO). Athens, Greece, 4th – 7th July 2007. Available from: http://www.bme.teiath.gr/medisp/pdfs/ATHANASSIADIS_2007_EpsMso_Segmentation%20of%20microarray.pdf
Συνέδριο: International Conference on Experiments/ Process/ System Modelling/ Simulation/ Optimization
Πρόσβαση: Δημόσια διαθέσιμο
Άδεια χρήσης: Αναφορά Δημιουργού-Μη Εμπορική Χρήση-Όχι Παράγωγα Έργα 3.0 Ηνωμένες Πολιτείες
URI: http://hdl.handle.net/11400/10403
Εμφανίζεται στις συλλογές:Δημοσιεύσεις

Αρχεία σε αυτό το τεκμήριο:
Αρχείο Περιγραφή ΜέγεθοςΜορφότυπος 
Segmentation of microarray images using Gradient Vector Flow Active Contours Boosted by Gaussian Mixture Models.pdf347.09 kBAdobe PDFΔείτε/ Ανοίξτε


Αυτό το τεκμήριο προστατεύεται από άδεια Άδεια Creative Commons Creative Commons