Please use this identifier to cite or link to this item: http://hdl.handle.net/11400/5422
Title: Αλληλουχικό υπόβαθρο της οροτυποποιητικής και υποτυποποιητικής αποτελεσματικότητας της PCR με εναρκτές URA-A/B στον Cryptococcus neoformans και ενδείξεις για μονόδρομη πολλαπλή αλληλική εκτροπή
Sequence basis of the serotyping and subtyping efficiency of URA-A/B PCR in cryptococcus neoformans and indications for one-way multilocus allelic shift
Authors: Τούκας, Δημήτριος
Καμπούρης, Μανούσος Ε.
Γαϊτάνης, Γεώργιος
Μενούνος, Παναγιώτης Γ.
Βελεγράκη, Αριστέα
Item type: Conference publication
Keywords: Loss-Of-Heterozygosity (LOH);single nucleotide polymorphism;Μονονουκλεοτιδικός Πολυμορφισμός (SNP);Απώλεια Ετεροζυγωτίας (LOH);Cryptococcus neoformans;URA5 gene;PCR;SSCP;Serotype AD;SNP
Subjects: Science
Biology
Επιστήμες
Βιολογία
Issue Date: 2-Feb-2015
2011
Date of availability: 2-Feb-2015
Publisher: Νερατζής, Ηλίας
Σιανούδης, Ιωάννης
Abstract: Το γενετικό υπόβαθρο της μοριακής υποτυποποίησης σε στελέχη Cryptococcus neoformans που επιτυγχάνεται με μεθοδολογία PCR-RFLP ή PCR-SSCP οδήγησε, μέσω αλληλουχοποίησης και στοίχισης αλληλουχιών στην ανίχνευση Μονονουκλεοτιδικών Πολυμορφισμών (SNP) με σταθερό αλληλικό καθεστώς και σαφή ανυσματική αλληλική εκτροπή. Εντός και μεταξύ των καθιερωμένων υποειδικών ταξινομικών βαθμίδων (ποικιλία και ορότυπος). Ο αλληλικός τύπος των κατά σύμβαση αλληλουχιών από οροτυποποιημένα και υποτυποποιημένα στελέχη υποδεικνύει την πιθανότητα οροτυπικής υποστροφής δια βαθμιαίας αλληλικής εκτροπής. Η φορά της υποστροφής είναι από τον ορότυπο Α μέσω του AD στον D, αν και παραμένει άγνωστο το αν αυτά τα βήματα μπορούν να γίνουν διαδοχικά από το ίδιο στέλεχος.
The genetic basis of the molecular subtyping of Cryptococcus neoformans isolates, performed by PCRRFLP and PCR-SSCP methodologies led through sequencing and sequence alignment to the detection of Single Nucleotide Polymorphisms (SNP) with consistent allelic status and a clear direction of allelic shifting within and among the accepted subspecies taxa (varieties and serotypes). The consensus sequence allelic status of the subtyped and serotyped isolates points to the possibility of serotype transition accomplished through a gradual allelic shift. The direction of the shift is from Serotype A to Serotype AD to Serotype D, although it is unknown whether these quantal steps can be taken by the same isolate.
Language: English
Citation: Toukas, D., Kambouris, M.E., Gaitanis, G., Menounos, P.G. and Velegraki, A. (2011). Sequence basis of the serotyping and subtyping efficiency of URA-A/B PCR in cryptococcus neoformans and indications for one-way multilocus allelic shift. "e-Journal of Science & Technology". [Online] 6(3): 1-12. Available from: http://e-jst.teiath.gr/
Journal: e-Περιοδικό Επιστήμης & Τεχνολογίας
e-Journal of Science & Technology
Type of Journal: With a review process (peer review)
Access scheme: Publicly accessible
License: Αναφορά Δημιουργού-Μη Εμπορική Χρήση-Όχι Παράγωγα Έργα 3.0 Ηνωμένες Πολιτείες
URI: http://hdl.handle.net/11400/5422
Appears in Collections:Τόμος 06, τεύχος 3 (2011)

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
Toukas_21.pdf756.91 kBAdobe PDFView/Open


This item is licensed under a Creative Commons License Creative Commons